根茎
石龙芮为一年生草本。须根簇生。茎直立,高10-50厘米,直径2-5毫米,有时粗达1厘米,上部多分枝,具多数节,下部节上有时生根,无毛或疏生柔毛。
叶
石龙芮的基生叶多数;叶片肾状圆形,长1-4厘米,宽1.5-5厘米,基部心形,3深裂不达基部,裂片倒卵状楔形,不等地2-3裂,顶端钝圆,有粗圆齿,无毛;叶柄长3-15厘米,近无毛。茎生叶多数,下部叶与基生叶相似; 上部叶较小,3全裂,裂片披针形至线形,全缘,无毛,顶端钝圆,基部扩大成膜质宽鞘抱茎。
花
石龙芮为聚伞花序有多数花;花小,直径4-8毫米;花梗长1-2厘米,无毛;萼片椭圆形,长2-3.5毫米,外面有短柔毛,花瓣5,倒卵形,等长或稍长于花萼,基部有短爪,蜜槽呈棱状袋穴;雄蕊10多枚,花药卵形,长约0.2毫米;花托在果期伸长增大呈圆柱形,长3-10毫米,径1-3毫米,生短柔毛。聚合果长圆形,长8-12毫米,为宽的2-3倍;瘦果极多数,近百枚,紧密排列,倒卵球形,稍扁,长1-1.2毫米,无毛,喙短至近无,长0.1-0.2毫米。
石龙芮花果期5月至8月。